つながったはずのライダーの歴史に、かつて幻として消え去ったはずの「仮面ライダー3号」が解き放たれた。
ショッカーを全滅させ、世界に平和をもたらしたはずの仮面ライダー1号&2号が、突如現れた3号によって抹殺された。再び世界に嵐が吹き荒れ、伝説の戦士たちは今また、その存在意義を問われることになる。仮面ライダーとは、いったい何者なのか。そして「仮面ライダー3号」が存在する意味とは? 仮面ライダー3号/黒井響一郎役に及川光博を迎え、史上最も美しく、最も尊き戦いが仮面ライダーの歴史に激震を与える。

1973年2月10日。仮面ライダー1号、2号によりショッカーは絶滅し、世界に平和が訪れた…はずだった。突如現れた謎の戦士、「仮面ライダー3号」。ショッカーが開発していた最強のライダーにより1号＆2号は抹殺され、その瞬間、歴史の歯車が狂い出す。
時は流れ2015年、全世界はショッカーの統治下にあり、泊進ノ介は仮面ライダーを倒すためにショッカーの一員になっていた。だが、激しい戦いの中で進ノ介は、子供まで盾にするショッカーの卑劣さを目の当たりにする。「子供たちの夢を守り、希望の光を照らす。それが仮面ライダーだ!」身を挺して子供たちを救った仮面ライダーBLACK・南光太郎の言葉が、進ノ介の心に突き刺さる。「何かがおかしい…」迷い始める進ノ介の前に、仮面ライダー3号・黒井響一郎が現れる。正義に目覚めたという黒井と共に、進ノ介はショッカーを倒すため動き出す。だが進ノ介は知らなかった。3号こそが1号＆2号を倒した闇の戦士だということを…。進ノ介の行く手に、凶悪な罠が待ち受ける。仮面ライダーたちの運命は? その結末は、史上初の「ライダーグランプリ」にゆだねられる! ショッカーに属する悪のライダーVS正義に目覚めたライダー。最強最速を決するレーシングバトルが開幕する!!