STORY
近未来。荒廃した関東地区。悪の組織「豹の爪(パンサークロー)」により都庁は破壊され、首都機能は地方に移行していた。府中Dブロックにある、聖チャペル女学園。選ばれた女子生徒にしか入学できないお嬢様学校だった。その特別科に転校してきた、如月ハニー。 ある日、学園が謎の怪人に襲われる。するとクラスメートの何人かが、突如変身し「新世代ハニー」となり怪人と戦い始めた…!驚くハニー。その時、ハニーの耳に亡き母親の声が聞こえる。「あなたはキューティーハニーなのよ」 如月ハニーは無意識に叫んでいた。「ハニーフラッシュ!」 如月ハニーはキューティーハニーに変身し、怪人を倒し、気を失う…! 目覚めたハニーの前に姿を見せたのは、パンサークロー対策本部の早見蒼だった…。 早見が語った真実とは…?聖チャペル女学園の真実の姿は…?ハニーはなぜ記憶をリセットされたのか…?「新世代ハニー」の能力とは…?そして現れた「ブラックハニー」とは…?